اولویت های پژوهشی مرکز تحقیقات پزشکی مبتنی بر شواهد مصوبه شورای پژوهشی مرکز عبارتند از:
- تولید مرور سیستماتیک در راستای لاین تحقیقاتی
- تدوین و بومی سازی راهنماهای بالینی مبتنی بر شواهد
- بکارگیری شواهد در سیستم سلامت
- انجام کارآزمایی های بالینی معتبر ملی و بین المللی
- انجام ارزیابی های فناوری سلامت مبتنی بر شواهد
- انجام مطالعات پایه در حیطه نورویورولوژی